Stref_00240 : CDS information — DoBISCUIT

Category 3.2 modification methylation Product putative O-methyltransferase Product (GenBank) O-methyl transferase Gene Gene (GenBank) stfMII EC number 2.1.1.- Keyword Note Note (GenBank) Reference
ACC
PmId
[16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006)
comment
steffimycin生合成gene clusterのクローニング、特徴づけ。

36ORFsが見つかり、そのうち24ORFsを含む26.5 kb領域がおそらくsteffimycin生合成に関連する。

stfMII : O-Methyltransferase

配列解析。

StfMII はdeoxysugar L-nogaloseのメチル化に関与するSnogYと近しいhomologueなので、

L-rhamnoseでのC-2′ hydroxy基のメチル化を担うmethyltransferaseでありうる。

Related Reference
ACC
O54261
NITE
Nogl_00410
PmId
[22120896] Identification of late-stage glycosylation steps in the biosynthetic pathway of the anthracycline nogalamycin. (Chembiochem. , 2012)
comment
Blast 3rd, id55%, 7e-97

Streptomyces nogalater_snogY

SnogY

[DoBISCUIT]demethoxynogalose C-2′ O-methyltransferase_snogY

aglycone生合成とdeoxysugar形成に必要な29ORFsを含むpSnogaoriを異種ホストS. albusに導入。

・3′,4′-demethoxynogalose-1-hydroxynogalamycinone

・nogalamineがC-C結合ありrhodosamineで置換されたnogalamycin R

・nogalamineがC-C結合なし2-deoxyfucoseで置換されたnogalamycin F

がS. albus/pSnogaoriで産生された。

sno clusterにあるO-methyltransferase候補のうち、pSnogaoriにはsnogYが含まれるが、snogM and snogLは含まれない。

S. albus/pSnogaoriの産物はどれもnogalose部分のC2’にmethoxy基を含むので、SnogYがC2’でのO-methylationを担う。

提唱経路schemeでは、aglyconeに付着されてからメチル化を受けるとされている。

ACC
Q2P9Y7
NITE
Stref_00280
PmId
[16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006)
comment
Blast 18th, id42%, 2e-66

Streptomyces steffisburgensis_stfMIII

同じstf cluster内にあるhomolog

配列解析によりmethyltransferase候補とされ、他の候補であるStfMI, StfMII の機能推定からの消去法で8-hydroxyl基のO-methylationが割り当てられている。

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