Pact_00210 : CDS information — DoBISCUIT

Category 3.4 other modification Product putative 6-methylsalicylyltransferase Product (GenBank) ketoacyl-ACP synthase Gene pctT
ptmR Gene (GenBank) pctT EC number Keyword Note Note (GenBank) Reference
ACC
PmId
[17827660] Cloning of the pactamycin biosynthetic gene cluster and characterization of a crucial glycosyltransferase prior to a unique cyclopentane ring formation. (J Antibiot (Tokyo). , 2007)
comment
Pactamycin生合成遺伝子クラスターの報告。

PctT: ketoacyl-ACP synthase

相同性より機能付けされている。

このORFの機能解析はされていない。

PctTは6-methylsalicylic acid (6-MSA)を形成に関与すると推測しており、その生合成経路は2つの仮説を立てている。

・PctK(discrete ACP)へacetyl-CoAと共にPctT(ketoacyl-ACP synthase)が運ばれpriming reactionが起こりPctS(iterative type I PKS)により6-MSAを合成。

・PctSがacetyl-CoAとself-primingし6-MSAを合成。産生した6-MSAはPctKと一緒にPctTにより活性化し6-MSA-ACPを合成。

Related Reference
ACC
B7TWM5
PmId
[19670201] Deciphering pactamycin biosynthesis and engineered production of new pactamycin analogues. (Chembiochem. , 2009)
comment
S.pactum ATCC27456のPactamycin生合成遺伝子クラスターの報告。

PtmR: 3-oxoacyl-(ACP) synthase

このORF(Pact_00210)と1aa短い配列でPtmRとして登録している。PtmRの機能解析はされていない。

NBRC株にて6-MSA合成に関与するとされたPctK,T,Mに相当するORF PtmI,R,Kは6-MSAの合成ではなく3-aminoacetophenoneの側鎖形成に関与すると推測している。これに関して本文中記述なし。

ACC
Q0R4P5
NITE
Chth_00090
PmId
[19266533] Dissection of two acyl-transfer reactions centered on acyl-S-carrier protein intermediates for incorporating 5-chloro-6-methyl-O-methylsalicyclic acid into chlorothricin. (Chembiochem. , 2009)
comment
Streptomyces antibioticus

ChlB3

[DoBISCUIT]6-methylsalicylyltransferase

異種性発現、精製したChlB1 ACP domain, ChlB2, ChlB3, ChlB6を使い、ChlB1(PKS)-ACPからChlB2(ACP)への6-methylsalicyl transferがChlB3によるものであり、ChlB6ではできないことをHPLCで確認している。6-methylsalicylic acid(6-MSA)では活性が検出されないので、ChlB1(PKS)-ACPから6-MSAとして放出されることなく、直接ChlB2(ACP)へ移動される。

Conflict
Sequence
H (295..295)
Comment
conflict with B7TWM6 (delete)

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