Cosmo_00080 : CDS information — DoBISCUIT

Category 1.1 PKS Product polyketide synthase chain length factor subunit Product (GenBank) CosC Gene Gene (GenBank) cosC EC number Keyword Note Note (GenBank)
  • ketosynthase – beta subunit
Reference
ACC
PmId
[16810496] Insights in the glycosylation steps during biosynthesis of the antitumor anthracycline cosmomycin: characterization of two glycosyltransferase genes. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2006)
comment
cosmomycinsを含むanthracycline複合体retamycinの産生株Streptomyces olindensisの染色体14kb領域から、cosmomycin生合成に関連した13genesを同定。

cosC: Ketosynthase beta

minimal PKSは20C anthracycline骨格形成を担うと考えられる。

ふつうはKS-CLFの下流にACPがあるが、シークエンスされた領域にACPなし。

類似した状況として、S. peucetiusにおけるdaunorubicin生合成clusterが挙げられている。このclusterではKS-CLFと離れてACPがある。

Related Reference
ACC
Q9L550
NITE
Acla_00080
PmId
[12137949] Cloning and characterization of Streptomyces galilaeus aclacinomycins polyketide synthase (PKS) cluster. (Gene. , 2002)
comment
Blast 4th, id66%, 1e-143

Streptomyces galilaeus_aknC

AknC

[DoBISCUIT]polyketide synthase chain length factor subunit

aclacinomycin PKSを含んだ13.5kb領域のクローニング、シークエンス報告論文。

AknC: ketosynthase II (KS-beta)

active siteを保存していない。

plasmid pSgsPCR6(aknBCDE2F)は、S.galilaeusのminimal PKS不全mutant H071を相補し、anthracyclinone産生を回復。

S.lividans TK24 and A.coelicolor CH999において、pMC10aM導入でauramycinone産生。

pMC10aMのminimal PKS genes(snoa123)をaclacinomycin clusterのminimal PKS genes(aknBCDE2F)で置換して導入するとaklavinone産生。

aknC単独での機能確認はされていない。

ACC
Q55224
NITE
Dauno_00170
PmId
[9098068] Minimal Streptomyces sp. strain C5 daunorubicin polyketide biosynthesis genes required for aklanonic acid biosynthesis. (J Bacteriol. , 1997)
comment
Blast 34th, id63%, 1e-120

Streptomyces sp.(Strain C5)_dauA

Polyketide synthase

cos cluster論文で挙げられているように、ACPがKS-CLFから離れて存在する。

daunorubicin (DNR), doxorubicin (DXR)の前駆体であるaklanonic acidを異種性ホストで産生するために必要な最小遺伝子は、dpsG (ACP), dauI (regulatory activator), dpsA (KS alpha), dpsB (KS beta), dpsF (aromatase), dpsE (polyketide reductase), and dauG (putative deoxyaklanonic acid oxygenase)であるということを実証している。

dpsB (KS beta)がこのentryに相当。

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